Троицкая церковь — самое большое церковное сооружение времен князей-епископов в Новом Городе и важное культовое сооружение Зальцбурга на правом берегу реки Зальцах.
Церковь построена в виде симметричного здания. Строительство происходило в 1694—1702 гг. Поручил построить церковь и семинарию учредитель епископского княжества Иоганн Эрнст фон Тун. Проект церкви был выполнен в 1694 г. Церковь уже была открыта в 1699 году, но строительство было еще не окончено.
Троицкая церковь и церковь Святого Иоанна (госпитальная церковь) строились одновременно и обе являются первыми строениями Иоганна Бернарда Фишера фон Эрлаха. Образцом служили различные культовые сооружения Рима (прежде всего церковь Св. Агнессы в Агоне на площади Навона работы Франческо Борромини).
Вместе с Фишером фон Эрлахом и Бернардом Михаэлем Мандлем над постройкой работали также такие скульпторы и каменотесы, как: Вольф Вайсенкирхнер, Матиас Вильгельм Вайсенкирхнер, Себастиан Штумпфеггер, Андреас Гётцингер и Лоренц Дрэксль.
Ранее фасад церкви Святой Троицы был обращен не к площади Макартплатц, как сейчас, а к узкой улочке между нынешней Райнерштрассе и Линцергассе. В настоящее время церковь с боковыми пристройками формирует великолепный ансамбль на одной из сторон площади Макартплатц.
Изначально низкие церковные башни, позже были увеличены для лучшей узнаваемости церкви. Колокольня была построена в 1757 г., верхние наконечники башен были достроены после пожара Нового Города в 1818 г.
Над внешним церковным порталом на аттике перед куполом находятся четыре статуи, три из которых символизируют человеческие добродетели, Веру, Надежду и Любовь. Четвертая фигура представляет собой божественную мудрость. Все четыре статуи созданы Бернардом Михаэлем Мандлем. Мжду фигурами находится двойной герб князя-епископа Иоганна Эрнста фон Туна, связанный с гербом земли Зальцбург.
Внутри церковь представляет собой помещение в виде вытянутого овала с четырьмя короткими сводчатыми перекладинами, над которыми господствует купол.
Большая фреска купола создана Иоганном Михаэлем Роттмайром в 1697—1700 гг. Это была первая фреска этого художника, она изображает коронование Марии Святой Троицей при поддержке архангела Михаила, других ангелов, пророков, 10 святых Пап, других святых и церковных патриархов. Фреска эффектно вмещает в себя историю христианских святых и церкви. На верхнем фонаре изображен голубь, символизирующий Святой Дух.
Лепная работа проведена Андреа Саллари и Иоганном Баптистом Реди. В главном помещении она ограничивается капителью.
Главный алтарь сооружен по проекту Фишера фон Эрлаха в 1700 г. В 1841 г. он был переработан, а в 1947 г. вновь возвращен к первоначальной форме. На нем помещена группа Св. Троицы с двумя молящимися ангелами. Рака с мощами Св. Эрнеста была создана Отто Проссингером в 1959 г.
На обоих боковых алтарях находятся роскошные статуи ангелов, спроектированные Фишером фон Эрлахом и созданные Бернардом Михаэлем Мандлем. Статуя Св. Марии на правом боковом алтаре изготовлена в XVI веке. Барочные рамы выполнены Себастианом Штрумпфеггером.
В левом крыле — гробница ордена Св. Руперта, на ней находятся мраморные плитки с эпитафиями. В этой гробнице покоится сердце князя-епископа Иоганна Эрнста фон Туна в саркофаге, который был построен Фишером фон Эрлахом.
Вестибюльная решетка относится ко времени постройки церкви. В ней искусно создан герб Иоганна Эрнста фон Туна. Мраморный пол церкви представлен в виде лучей, которые ведут во все стороны от среднего овала с надписью.