Церковь была построена в 1050 г. архиепископом Адальбертом Бременским перед воротами города.
Приход Святого Стефана в 1139 г. был объединен с приходом Санкт-Виллехад и повышен до верховного прихода архиепископом Адальбертом II.
Сто лет спустя церковь была обновлена после пожара Гебхардом II.
В конце XIV века она была перестроена в трехнефную церковь.
С 1856 г. 72-метровая башня является одним из важных элементов силуэта города.
Реставрация 1888—1891 гг. существенно изменила облик здание. Продольное вытянутое строение было при этом воссоздано заново, также как и северная башня. Архитектурная деталь между башнями была создана в свободной форме.
В 1944 г. церковь была сильно повреждена в результате попадания бомбы. Осталась стоять только южная башня, также полуразрушенная. Южный неф не был вновь отстроен. Северный неф был отделен от центрального, который был с 1947 по 1959 г. вновь отстроен под руководством архитектора Артура Боте. Пролет восточного нефа был перестроен в поперечный неф.
К достопримечательностям церкви относятся барочная люстра (XVII век), орган работы Рудольфа фон Бекерата (1965 г.), окно хоров работы Эрхарта Митцлаффа (1967 г.).
С 1960 года количество прихожан уменьшилось с 6000 до 1500 человек. Главным образом это произошло вследствие миграции населения из центра города в пригороды.
В церкви регулярно проводятся концерты церковной музыки.