Новая церковь была построена Юлиусом Эхтером в 1582 г. как университетская церковь, совместно со старым университетом.
При бомбардировке города во Вторую Мировую войну церковь была значительно разрушена, восстановление длилось много лет.
В 1970 г. сенат университета решил использовать церковь для конгрессов, семинаров и концертов.
В 1977 г. было окончено строительство купола башни, тем самым была полностью закончена реконструкция церкви снаружи и начата реконструкция внутри. В конце концов, 7 ноября 1985 г., через 40 лет после разрушения, церковь была торжественно открыта как актовый зал университета.
Башня церкви, которая видна издалека, была построена в три этапа и тем самым содержит в себе три различных стиля. Она имеет 91 метр в высоту и является самой высокой башней Вюрцбурга. Но не только поэтому церковь является очень популярной достопримечательностью — она также является одной из самых значительных церквей эпохи Возрождения в Германии.
В 2005 г. в башне был установлен карильон — система колоколов. Он состоит из 51 колокола. Самый большой имеет диаметр 1 м., высоту 85 см., массу 635 кг. и украшен гербом университета. Самый маленький колокол весит всего немного более 4 кг. В то время Вюрцбург был первым и единственным немецким университетом, в котором находился карильон. В Европе были лишь три таких города — Амстердам, Лёвен и Роттердам.