Церковь Иоанна Богослова расположена недалеко от Ипатиевского монастыря. Когда-то, эта территория была «особой экономической зоной» (поселенцы освобождались от ряда налогов), созданная для того, чтобы было, кому кормить монахов. Принадлежала монастырю с XV века. Когда в середине XVII века монастырям запретили владеть слободами, монахам удалось обойти этот запрет, сославшись на то, что слобода отделена от монастыря рекой (на самом деле, жалким ручьем, ныне спрятанным в трубу).
Застройка нынешней слободы без существенных искажений представляет ее облик по состоянию на XVII столетие. Центром слободы служит прекрасно сохранившаяся церковь Иоанна Богослова.
Церковь Иоанна Богослова каменная, с каменной колокольней была построена в 1681–1687 гг. вместо двух деревянных церквей, устроенных в 1562 г. по грамоте Московского митрополита Макария и сгоревших в 1681 г. Построена она по благословению патриарха Иоакима, попечением настоятеля Ипатьевского монастыря архимандрита Антония.
Придельный храм с престолами во имя святого Николая и в честь Феодоровской иконы Божией Матери устроен в 1901 г.
